送入宫中的急报来自松江府。除了当地官府的奏禀之外，驻扎于松江府的锦衣卫千户所随后也送来了更加详细的奏报。
据松江府知府、通判、提刑按察使等人在联名奏报中声称，在松江府上海县沿海一带规划筹建码头的工部官吏与当地百姓发生纠纷，继而引发小规模民变，冲突共造成工部相关人员三死八伤，码头上的许多建筑物也被捣毁或焚烧，港口建设陷入停顿状态。
由于当地气温较高，为防止疫病发生，遇难者遗体已被火化，伤者已经送往城中进行抢救和诊治。
当地官府虽然于事发后出动捕快衙役赶赴现场，但参与杀伤人命者已经逃散一空，由于现场遗留物太多，而且缺乏目击者，所以无法对相关人员进行认定，故此特上禀朝廷，恭请圣裁。
而锦衣卫随后送达的奏报和官府所说截然相反。
在事件发生一个时辰之后，驻松江府的千户才接获消息，并立刻带队赶往现场，于一个时辰后到达事发地，此时现场除了死难者和伤者外已无他人在场，上海县衙门以及松江府衙门官吏则是比他们到的更晚。
经锦衣校尉仔细搜寻后，在离事发现场不远处的树林中发现了一柄被遗弃的带血短刃。
锦衣卫在奏禀中声称，这次朝廷官员被袭事件，绝不是民变，而是一次有预谋、有针对性的恶性案件。但是由于现场遗留的线索太少，所以暂时无法追查到案件的谋划者和行凶者。松江千户所已经派出大量人手四处查访，争取早日将此案侦破。
“大伴，宣内阁首辅、次辅、大学士卢建斗、范梦章入宫议事！锦衣卫北镇抚司镇抚使李烈即刻带人南下松江府！另尽速遣人知会明州、广州亲军千户所，立即安排人手保护工部相关人等！还有，遣人知会冯顺，若福建事了，缇骑即刻分队转赴松江府、明州府、广州府，探查防范可疑动向！”
阅罢两份截然不同的奏报后，朱由检阴着脸开口吩咐道，王承恩赶忙一溜小跑来到殿门口，招呼过两名小太监后交代了几句，两名小太监躬身施礼后飞也似地转身跑去。
朱由检心里已经认可了锦衣卫对这次事件的判断，而松江府的奏本其实就是官样文章，内容更像是打算把事情糊弄过去，至于还有没有更深层次的原因，眼下还不好做出判断。
这件事明摆着就是冲着开海来的。
内阁已经行文相关各府县，沿海各地的所有私人码头将在半年后全部停止使用，之后所有商船都要到朝廷建设的港口停靠。
紧接着，工部派遣一批技术型官员南下，在相关地区勘测地形后开始建设规模更大的码头，并完善相关配套设施，以便于后续更多商船的停靠和使用。
很显然，一旦这条政策开始实施，所有的商船都会被征收商税，这对众多江南各地的海商们来说是不可接受的。殴杀朝廷官员这件形同造反的恶性事件，肯定就是这个利益集团中有人谋划并着手实施的。
但由于江南一带从事海贸的商人太多，新港口也处于比较偏僻的地方，加上组织者的精心策划，所以很难找到目击证人，想要找到元凶无异于大海捞针。
正在朱由检沉思之时，随着殿门外太监的高声通禀，温体仁等人联袂来至乾清宫，朱由检随即吩咐一声，众人移至昭仁殿内，开始就此事进行会商。
“启奏圣上，臣等以为，此事绝非松江府所报称之民变，应是有人刻意为之。若真是如此，那此举已于谋反无异！
臣等以为，圣上当即刻下旨遣刑部相关官吏南下侦办此案，并责令松江府予以全力配合，待找出幕后指使者后予以明正典刑，以此震慑其余别有用心者！”
在众人落座之后，首辅温体仁率先起身施礼后上奏，给出了内阁对此事的判断和处置策略。
松江府的奏报经通政司后先递入内阁中，在阁臣们传阅过后才送入宫内。在这期间，众人已经就此事进行了简短的会商，并很快达成了一致。
“内阁此断与朕所思相符，松江府诸人未经详细查访便仓促给出民变之论，若非别有用心，那也是渎职之罪！待此案最终水落石出之时，要追究相关官员责任！
既是内阁已有方略，那便即刻照此施行吧！朕已遣亲军北镇抚司南下侦办此案，不管是刑部还是亲军，在办案期间要通力合作，尽快将案件侦破，还伤亡者一个公道！
青天白日、朗朗乾坤，竟有人胆敢公然谋划袭杀朝廷官员，其行为可谓是丧心病狂之极！此举无非是妄图阻止开海之大计！
朕会让某些人明白，此策事关国计民生，也事关皇明未来之百年大计，若有敢于螳臂当车者，杀无赦！
此事事关重大，故须朝廷重臣前往督之！朕意以卢卿为钦差，亲赴江南一地，全权负责与此案相关事宜！”
虽然北镇抚司职权极大，可以逮治有关官员人等，但考虑到不能所有事都要经锦衣卫之手完成，那样的话，不光是朝臣们意见很大，久而久之，也会形成锦衣卫一家独大的局面，不利于依法治国的政策实施。所以朱由检考虑再三后，还是决定派遣重臣南下督阵，以防止锦衣卫滥用职权。
“启奏圣上，臣以为，侦办此案之同时，开海一事也须加快进行。臣建议加大港口码头建设力度，多多雇佣民壮，并从当地聘用熟悉港口建设之人才协助工部官吏，力争早日建成并投入使用！”